• 1.背景介绍:测序时通量和假阳性相互矛盾：高通量时如果液滴将不同类型的细胞封装在一起，那么可能带来假阳性现象（以为发现了新细胞类型但实际上没有）
• 2.使用染色技术cell hashing识别并删除多细胞液滴MSM,提出三个任务:
  • 1.找到多细胞液滴:使用高斯混合模型拟合细胞颜色分布
    
  • 2.计算删除这些找到的多细胞液滴后剩下的多细胞液滴:多种染色但是颜色相同的多细胞液滴无法被删除，因此可以建立概率模型进行评估
    
    
  • 3.评估:计算后可以建立假设检验模型判断新发现的细胞类型是否真实存在还是由于多细胞液滴造成的假阳性。
    
    

背景介绍:

既不能不进行标准化，也不能假设液滴中的细胞数基本一致，因此考虑到使用多细胞液滴作为质控工具

使用多细胞辅助质控，最终让原本一半上升一半下降的结果变成更加真实的情况。例如下图中的Eef2,Cd47等基因在RPKM分析中基本不变但是实际上全都上调。

背景介绍:

希望亚型分类时不但能找到marker，而且能够结构化。

重点:

• 1.找marker:看基因对比看单个基因更容易区分出不同的细胞型，利用这种互斥性寻找基因对
• 2.找大类亚型的关系:建立算法将可能是同一个细胞型的基因识别出来
• 3.找大类的层次化关系:大类关系可以利用此图的补图实现（如果两个基因是大类关系那么久不存在互斥，例如T细胞亚型和其子集的亚型不互斥）